茶黑刺粉虱线粒体基因组的测序与鉴定

来源 :中国植物保护学会2016年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Cantarali
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  茶黑刺粉虱(Aleurocanthus camelliae Kanmiya & Kasai,2011)隶属于半翅目(Hemiptera)粉虱科(Aleyrodidae)刺粉虱属(Aleurocanthus),是茶园中的一种重要的害虫,发生严重时可诱发茶叶感染烟煤病,使叶片枯死脱落,严重影响茶叶的质量和产量.线粒体基因组(mitochondrial genome,mt genome)因具有母系单性遗传、基因组分子较小、基因组结构保守、进化速率快和包含大量进化信息等特点,使其被广泛应用于昆虫种类鉴定、种群遗传学及系统发育研究中.本实验使用PCR(rTaq)和Long-PCR(LA Taq)技术对黑刺粉虱的线粒体基因组全序列进行扩增,得到7条两端相互重叠的大基因片段.对纯化后的7条PCR片段直接进行步移法测序,将获得的序列进行拼接组装、校正和注释,获得黑刺粉虱的全线粒体基因组.实验所得茶黑刺粉虱线粒体全基因组为单一闭合环状双链DNA分子,全长15 188bp,碱基组成为A=30.12%,C=12.38%,G=16.72%和T=39.87%,编码了13个蛋白质编码基因(cox1-3,cytb,nad1-6,nad4L,atp6和atp8),21个tRNA基因(tRNACys,tRNAGln,tRNAMet,tRNATrp,tRNATyr,tRNAL eu(CUN),tRNALeu(UUR),tRNALys,tRNAAsp,tRNAGly,tRNAAla,tRNAArg,tRNAAsn,tRNASer(AGN),tRNASer(UCN),tRNAGlu,tRNAPhe,tRNAHis,tRNAPro,tRNAPro和tRNAVal),2个rRNA基因(rrnS和rrnL),缺失tRNAlle基因.同时,基因组还包含1个控制区域,由一段Poly-T和两段重复序列构成,全长875 bp,A+T含量为66.86%,位于tRNASer(AGN)和tRNAMet之间.目前,已有7种粉虱的线粒体基因组被发表,具有较为普度的基因重排和基因缺失现象.基因重排方面,粉虱中具有典型的cox3-tRNAGly-nad3区块的转移和tRNACys和tRNATyr的位置交换,这在茶黑刺粉虱线粒体基因组中同样出现.茶黑刺粉虱具有独一无二的基因排列,且与Tetraleurodes acaciae具有最为相似的基因排列.基因缺失方面,主要是tRNA基因的缺失,包括RNAAla,tRNAArg,tRNAIle,tRNA Ser(AGN),tRNASer(UCN),tRNAAsn和tRNAGln等,其中tRNAlle基因是最常见的缺失基因,在茶黑刺粉虱线粒体基因组中也没有被鉴定出.
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