猪捷申病毒8型吉林分离株和富裕分离株全基因组测序和分析

来源 :第十届全国病毒学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cgm
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  本实验针对PTV8-Jilin2003-2和PTV8-Fuyu2009-2两株猪捷申病毒8型毒株(PTV8)开展了全基因组的测序工作,应用大连宝生物公司的5 RACE和3RACE试剂盒分别对这两个毒株进行5 UTR和3UTR克隆和测序,应用7个相互交叠的片段进行PCR扩增、克隆和测序。成功完成了PTV8-Jilin2003-2株和PTV8-Fuyu2009-2株全基因组测序工作,并应用序列分析软件进行序列比对分析,结果表明:PTV8-Jilin2003-2株和PTV8-Fuyu2009-2株全长分别是7126bp和7128bp;两株PTV8的5UTR序列完全相同,且无长的poly(C)结构;3UTR仅相差2个碱基A;两株PTV8在ORF区有两个碱基存在差别,而5 UTR与口蹄疫病毒和脑心肌炎病毒具有完全相同的头部序列"TTGAAA",与牛肠道病毒也具有很相似的头部序列"TT×AAA"。这是首次关于PTV8全基因组测序的报道,两株PTV8全基因组序列的获得为猪捷申病毒的分子流行病学研究和反向遗传操作系统的建立奠定了前期工作基础。
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