基于极大似然估计的分子序列修正Kimura双参数距离

来源 :中国运筹学会第七届学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangshuanghong2009
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在目前分子序列比较的研究中,Kimura双参数距离是应用很广的一种距离,然而该距离公式对从实际分子序列得来的两种类型碱基对的数目P和Q有一定的取值限制.本文在描述分子序列进化的Kimura双参数模型的基础上,利用极大似然估计法估计该模型的两个参数——transition替代率α和transversion替代率β,并由此得出修正Kimura距离,克服了传统Kimura距离中对P和Q的取值限制.
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