枣半同胞家系子代遗传多样性分析

来源 :第六届全国果树分子生物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:studycomputer1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  以JMS2、交城五号、酸枣邢台16号及JMS2的277个子代为材料,采用SSR分子标记技术研究半同胞家系的遗传多样性.从供试的27对引物中挑选出10对条带清晰、重复性好的SSR引物用于试验.用改良的CTAB法提取基因组DNA后,采用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR反应产物.对扩增条带进行统计,将数据转换成软件识别的格式后利用POPGENE软件分析供试样品的遗传多样性,并用NTSYS-2.10软件分析,用UPGMA方法进行聚类分析.10对引物对280份样品进行分析,共检测出35个等位基因,平均每个位点3.5个等位基因.检测等位基因最多的引物是JSSR311和JSSR186,各检测出5个等位基因;最少的为JSSR102和JSSR480,各检测出2个等位基因.有效等位基因数从1.185 (JSSR191)到4.340 (JSSR311),平均为2.111.观测杂合度变化范围为0.155~0.907,平均为0.572;期望杂合度变化范围为0.156~0.771,平均为0.472;Shannon多样性指数平均为0.820,Nei多样性指数平均为0.471.据形成的聚类图得知,遗传相似系数的分布范围为0.57~1.00,在聚类阈值为0.72处,280个样品被划分为10大类.结果 表明雄性育种质(JMS2)子代的遗传多样性水平较高,基因分化系数在不同的位点的差异显著,其中最大为0.659,最小为0.146,平均为0.407,说明在总的遗传变异中有40.7%的变异来自予不同的类群之间,大部分存在于子代个体间.本研究可以为进一步评价利用枣雄性不育种质JMS2半同胞家系提供参考.
其他文献
菠萝自然开花受外界环境因素影响较大,在开花时间、开花率等方面都具有较大的不确定性。因此在商业化生产中通常采用乙烯利进行诱导菠萝开花,可明显提高开花的整齐度和开花率,有效调节菠萝上市时间。在植物体内乙烯可以调控一系列衰老相关的基因,同时乙烯在诱导开花的过程中也扮演着复杂多变的角色,而关于乙烯诱导菠萝花芽分化的分子机理却知之甚少。本研究采用RNA-Seq技术,进行了乙烯利诱导下菠萝品种台农16号转录组
以贵农5号刺梨(Rosa roxburghii TrattGuinong 5)为试材,采用果实离体喂饲的方法研究外源SA和MJ对刺梨果实AsA合成的影响,结果表明:2.0 mmol·L-1 SA对刺梨果实AsA的合成有显著的促进作用,而刺梨果实在经过16 h 10-2 mmol·L-1 MJ喂饲后,AsA的合成量降低.对外源SA和MJ处理下刺梨果实AsA合成相关基因表达水平进行实时荧光定量PCR
以着色嘎拉和非着色金冠两个品种苹果果皮为试材提取总蛋白,用TiO2富集磷酸化肽段,对富集到的磷酸化肽段进行高效液相色谱分离,利用质谱鉴定磷酸化肽段,采用Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4 (thermo)软件进行蛋白质查库鉴定,使用的数据库为Uniprot_ Maloideae.fasta.对鉴定到的磷酸化肽段和蛋白质进行分析,找出着色与非着色苹果品种中有差异的磷酸化
微卫星标记技术(SSR)在植物种质资源多样性研究及分子育种等方面的应用越来越广泛.高通量测序技术的发展使SSR标记开发更为快速且低成本.笃斯越桔为杜鹃花科越橘属多年生落叶灌木,果实富含花青素和黄酮类物质,有很高的营养价值和经济价值.利用SSR标记对笃斯越桔野生种质资源的研究尚未见报道.本研究以笃斯越桔成熟果实为材料,利用高通量测弃技术进行转录组测序,共获得34.62Gb Clean Data, Q
笃斯越桔是杜鹃花科越桔属野生浆果,经济价值极高.白果笃斯为野生资源中发现的变种,其主要变异性状为成熟期果实银白色,几乎不含花青苷,是研究果实着色机理优异资源.本研究以笃斯越桔及其白果变种的成熟果实为试材,进行转录组测序并利用荧光定量PCR对两个样品花青苷合成途径中部分结构基因及转录因子VuMYB PA的表达进行了验证,其结果为:转录组测序共获得34.62Gb Clean Data,获得42837条
[目的]为果桑种质的有效利用、资源保护和新品种选育提供理论依据.[方法]以209份果桑种质为材料,应用相关性分析、因子分析和聚类分析等方法对供试种质的7个主要农艺性状进行调查分析,研究其遗传多样性.[结果]209份果桑种质的5个数量性状和2个质量性状差异明显,遗传变异较大,其多样性指数为1.45~2.03,平均遗传多样性指数为1.81.果桑种质的开花和成熟时期与米条总芽数、米条座果芽数、米条座果粒
草莓转录组中特异表达基因密码子的使用偏好性分析能够为基因异源表达提供参考,为了探究红蓝光处理对其影响,以本实验室前期红蓝光处理后的草莓转录组数据为原始实验数据,以白光处理的草莓转录组数据为原始对照数据,利用perl语言及测序结果中的FPKM值(Fragments per kb per million fragments)对转录组数据进行筛选,通过EMBOSS及Mobyle在线程序对筛选得到的特异表
葡萄坐果不仅影响果实中能否形成正常发育的种子还影响果穗外观形状和果粒大小并与果实发育质量、产量和果园生产效益紧密相关。赤霉素在葡萄生产中诱导无籽葡萄的形成和促进坐果已经得到广泛应用,但是赤霉素对葡萄坐果的分子机制依然不清。本研究利用外源GA3和GA生物合成抑制剂PAC(paclobutrazol)处理分析了它们对葡萄坐果的影响,并对坐果过程中活性GA含量进行测定,同时分析了GA合成关键酶VvGA3
MADS-box转录因子是植物生长发育过程的重要调控因子。为了解菠萝MADS-box转录因子的序列特征和分类情况,本文采用生物信息学方法,对菠萝全基因组的MADS-box进行序列分析,包括菠萝MADS-box转录因子的数量、外显子和内含子组成情况、编码蛋白的基本特性及系统进化树的分析。结果 表明,菠萝基因组中有40个MADS-box转录因子,且基因结构分析表明8个菠萝MADS-box基因符合植物M
以冬枣花为试材,利用同源克隆法技术获得了枣ATP1基因序列.克隆所得序列在NCBI数据库中进行BLASTN分析,确定该基因ORF长度为1530bp,编码509个氨基酸.与葡萄、苹果的序列同源性分别达到98%、97%.进一步利用ProtParam tool、Protscale、TMHMM、PSORT、SignalP4.1 Server、ExPASy Proteomics Server等软件对该序列进