【摘 要】
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单核苷酸多态性(SNPs)标记非常适用于遗传学和进化学研究.本研究首次报道了重要经济蟹类一拟穴青蟹的SNP标记.对15个功能基因的部分序列进行测序,获得了12,500bp的高质量
【机 构】
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中国水产科学研究院东海水产研究所,上海200090
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单核苷酸多态性(SNPs)标记非常适用于遗传学和进化学研究.本研究首次报道了重要经济蟹类一拟穴青蟹的SNP标记.对15个功能基因的部分序列进行测序,获得了12,500bp的高质量DNA序列.通过对8个不同个体的同源序列的比对,结果发现了37个SNP位点,平均每338bp存在1个SNP位点.利用SNaPshot分型方法对这些位点在一个拟穴青蟹群体中的多态性的分析表明,有24个位点能够成功分型,且所有位点都包含2个等位基因.每个位点的最小等位基因频率在0.02～0.44之间,观测杂合度和期望杂合度分别在0.04～0.59和0.04～0.50之间.所有24个位点均符合哈代-温伯格平衡.连锁不平衡分析表明,有6个位点对之间存在连锁关系,但经过sequential Bonferroni校正之后,不存在两两连锁的位点.本研究报道的SNPs标记将为拟穴青蟹遗传与进化研究增添新的分子标记.
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