豆天蛾核型多角体病毒光解酶变异基因序列的解析

来源 :华东六省一市生物化学与分子生物学会2008年学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jexwbx45535
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  紫外线是杆状病毒野外活性的主要抑制因子,光解酶可修复由紫外线引起的DNA光损伤.对新近发现的豆天蛾核型多角体病毒(CbNPV)进行分离纯化,提取其基因组DNA,用shotgun法构建了DNA片段的文库,并进行了全基因组测序.根据序列分析的结果,发现了一段长为1,694bp的光解酶类似基因序列,但与已报道的杆状病毒光解酶序列相对比,发生了一个碱基的缺失,从而使其分裂成两个小的读码框:Cbphr-1由306个核苷酸组成,编码101个氨基酸残基,分子质量约为12.1kD.转录起始位点上游48bp处具有早期基因转录的保守起始序列cagt,表明该基因为早期表达基因;Cbphr-2由1119个核苷酸组成,编码372个氨基酸残基,分子质量约为42.0 kD.在该基因的转录起始位点上游未发现早期(cagt)或晚期(taag)基因转录的保守起始序列.结构域分析表明,所有已知DNA光解酶都具有的CPD-DNA光解酶结构域和FAD-结合结构域在CbNPV中也保守存在.
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