正常发育与发育阻遏雌虫差异表达miRNA分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第十三次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woodofcn
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  血吸虫正常发育雌虫(混合感染雌虫)和发育阻遏雌虫(单性感染雌虫)存在显著的差异;miRNA是对生命活动具有调控作用的一类重要的功能分析.为进一步探索miRNA与雌虫发育阻遏的关系,通过HiSeq高通量测序技术,对感染后25天的正常发育雌虫和发育阻遏雌虫的小RNA进行深度测序,分析不同状态的雌虫miRNA表达情况,并通过Real-time PCR对找出的差异表达miRNA进行验证.通过对获得的原始Reads处理,正常发育雌虫和发育阻遏雌虫分别获得9358376和9314275高质量reads,均占总获得resds的95%以上.与基因组进行比对统计分析,获得序列55%左右比对上基因组.通过生物信息学方法对差异表达miRNA的分析表明,发育阻遏雌虫与正常发育雌虫相比后共获得21上调,17个下调显著的miRNA.大部分表达丰度高的miRNA,在发育阻遏雌虫中出现了显著的上调现象,例如:Sja-miR-let-7,Sja-miR-1等,这些miRNA在其它物种中发现对个体生长发育有重要作用.而在显著下调表达的miRNA中,包含对个体发育过程中有重要作用的bantam.通过对差异表达的miRNA进行靶基因的预测,对这些靶基因进行KEGG和GO分析,分析这些靶基因可能的调控作用.KEGG分析表明细胞粘附,细胞周期这两条通路中靶基因较多.GO的分析表明,差异miRNA的靶基因存在于不同的细胞组分中.
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