鸭RIG-I的全长cDNA的PCR扩增及其序列分析

来源 :第二届全国禽病分子生物技术青年学者论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuanshangsen
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  目的:本文旨在获得北京鸭RIG-I全长cDNA,并对RIG-I进行序列分析和结构预测。方法:通过融合PCR的方法,从北京鸭脾脏中扩增得到鸭RIG-I全长cDNA,并使用分子生物学分析软件进行序列分析。结果:序列分析发现鸭RIG-I开放阅读框全长2802bp,编码933个氨基酸。结构预测发现鸭RIG-I结构与哺乳动物类似,N端有两个串联CARD区,中间为DExD/H解旋酶区,C端为抑制区,各功能区起重要作用的氨基酸较为保守。同源性及进化树分析发现鸭RIG-I与鹅和斑马鱼的同源性最高分别为93.7%、78.4%,与哺乳动物同源性高于50%,与其它鱼类的同源性低于50%。结论:成功得到了北京鸭RIG-I全长cDNA,并对其结构进行了初步预测,为鸭RIG-I的深入研究奠定了基础。
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