基于特征选择的空间环境诱导秀丽隐杆线虫的敏感分子标记物的筛选及分析

来源 :中国空间科学学会空间生命专业委员会第二十届学术研讨会暨中国宇航学会航天医学工程与空间生物学专业委员会第四届学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dannychan
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  空间敏感的分子标记物的筛选对于空间环境的风险评估以及快速预警具有重要意义。本研究利用神舟8号飞船搭载实验平台,采用野生型dauer期的秀丽隐杆线虫作为受试生物,分别测定了空间综合、空间辐射以及地面环境下,线虫全基因组表达谱的变化;使用耦合多任务筛选算法,即包括四分位距(IQR)、方差分析(ANOVA)以及随机森林(Random Forests,RF),筛选三种不同的暴露处理条件下的敏感分子标记物。结果发现,使用IQR算法处理后得到1186个分子标记物,利用ANOVA算法处理后得到1189个分子标记物,而以上两种算法处理后共同变化的分子标记物有52个,且具有明显的环境特异性。本文利用RF算法处理后,发现52个变化的标记物的重要性具有明显的线性变化。在此基础上,本文分析了重要性大于2的23分子标记物的生物学功能,发现不同暴露处理条件下其生物学功能差异不显著。这对于进一步研究空间敏感的分子标记物的快速检测具有重要意义。
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