临床有效性是中药创新药物的前提, 中药药效物质基础的发现及确认技术是制约中药创新药物研究的共性关键技术.中药药效物质基础是指能够表达药物临床疗效的化学成分,在临床上,方剂对应的是证候或病,中医证候/病的客观正确诊断,阐释证候/病的生物学本质,发现证候/病的生物标记物,建立临床疗效的生物评价体系是发现中药药效物质基础的基本前提,也是基于中医临床经验创新药物的决定性环节.建立了系统的关联“证候诊断——方剂效应评价——体内直接作用物质分析”的方法学—中医方证代谢组学(Chinmedomics），将中药血清药物化学和代谢组学有机结合，在解决证候生物标记物的基础上，建立方剂药效生物评价体系，进而发现与临床疗效直接相关的药效物质基础，实现基于临床有效性的中药创新药物发现。