苹果锈果类病毒河北保定分离物序列分析

来源 :第四次全国植物抗病虫和病害流行与控制学术研讨会暨2015年西北植物病理学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sanji621
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  苹果锈果病又名花脸病或裂果病,是危害苹果较为严重的非潜隐性病毒之一,也是中国苹果上重要的检疫性对象.苹果锈果病的病原为苹果锈果类病毒(Apple skin scar viroid,ASSVd),异名苹果斑纹类病毒(Dapple apple viroid,DAVd)、梨锈皮类病毒(Pear rusty skinviroid,PRSVd).属于马铃薯纺锤块茎类病毒科(Pospivioidae)、马铃薯纺锤块茎类病毒属(Pospiviroid).陈炜等首次在国内报道了ASSVd,日本学者Hashimoto 等首次报道了ASSVd全序列,确认其为类病毒.本研究以采自河北保定的ASSVd 样本为实验材料,利用RT-PCR 技术对样本中的ASSVd 全基因组序列进行扩增,然后利用生物学软件MEGA6.0 对该分离物与已发表的其它分离物序列构建系统发育树,对系统进化关系进行分析.结果表明,ASSVd 保定分离物基因组全长332 nts,将序列提交到GenBank,登录号为KR264032.该分离物与已发表的其它13 个来自不同寄主、不同国家的ASSVd 分离物间进化关系极近,核苷酸相似性为92%-99%之间.与加拿大苹果上的分离株系X71599 亲缘关系最近,聚在一个亚组,同源性最高为99%,仅在第221 位多一个碱基T,与新疆梨上的分离株系JX861259 亲缘关系最远.
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