增生性瘢痕与正常皮肤中长链非编码RNA表达谱的变化

来源 :2014感染伤口的防治与修复研讨会、中国金属学会冶金安全与健康分会烧伤外科学专业委员会年会、华北地区烧伤与整形外科学术年 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yanxt99
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  目的 长链非编码RNA(lncRNA)曾被认为是基因组转录的"噪音",是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,不具有生物学功能.但近期众多研究表明,lncRNA以RNA的形式调控蛋白编码基因在多种层面的表达水平,与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等密切相关.本文观察人增生性瘢痕与正常皮肤组织中长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的变化.方法:收集增生性瘢痕患者手术切除的增生性瘢痕及其邻近正常皮肤组织,采用Traziol试剂提取总RNA,利用反转录酶逆转录合成双链互补DNA,以第二条链cDNA为模板体外转录cRNA,将转录得到的cRNA为模板反转录合成cDNA,纯化后荧光标记并与lncRNA芯片进行杂交,计算机扫描并分析芯片荧光信号图像,筛选出相对表达量比值在2倍以上的lncRNA作为差异表达的lncRNA,并用实时定量PCR进行验证.结果:人增生性瘢痕与正常皮肤组织相比较,lncRNA相对表达量比值在2倍以上变化的共5635条,2倍以上上调的共1918条,2倍以上下调的共3717条,5倍以上上调的共12条,5倍以上下调的共15条.定量PCR显示,增生性瘢痕H19、AC093850.2表达明显高于正常皮肤组织,而NAMA、XIST表达显著低于正常皮肤组织,与芯片分析结果相符.结论:人增生性瘢痕与正常皮肤组织比较,lncRNA表达谱发生了明显变化,可能与增生性瘢痕的发生发展密切相关,为寻找治疗靶标提供了新思路和依据.
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