长链非编码RNA在多发性骨髓瘤的差异表达及对预后的影响

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目的通过最新生物信息学方法筛选多发性骨髓瘤(MM)长链非编码RNA(lnc RNA)表达谱,及重要lnc RNA分子对MM患者预后的影响。方法使用最新生物信息方法,整合HG-U133Plus 2.0表达谱芯片检测MM的8套GEO数据,对芯片探针重新注释,筛选lnc RNA表达谱。利用生物信息学MCL算法及多因素统计分析等多种方法对差异lnc RNA及m RNA进行聚类分析及GO、pathway分析,构建lnc RNA引发MM的功能模式。同时结合美国阿肯色骨髓瘤研究中心553例MM完备临床资料数据(GSE24080),鉴定出影响预后的关键性lnc RNA。而后对可能影响预后的重要lnc RNAs分子GAS5和CRNDE-h在98例就诊我科统一接受PAD的初发MM患者血清的表达水平,通过Q-RT-PCR方法检测,并分析其异常表达对临床特征和预后的影响。结果在筛选lnc RNA表达谱分析中,共8个lnc RNA分子在MM患者与正常对照存在明显差异表达(P<0.001)。这些差异lnc RNA主要通过细胞周期通路(P<10-35),和凋亡通路(P<10-27)在MM发病中发挥作用。在对553例美国MM患者的数据分析中发现9个lnc RNA可影响预后,对应的靶基因就是阿肯色研究中心曾报道的70个基因。而后Q-RT-PCR方法对MM患者和52例健康对照组的血清GAS5和CRNDE-h发现在MM患者血清中的表达均显著高于健康对照组(P<0.001)。而MM患者中CRNDE-h高表达组与年龄(P=0.046)、FISH高危因素(P=0.004)及高钙血症具有直接相关性;而CRNDE-h高表达者较CRNDE-h低表达组具有较差的PFS(P=0.026)和OS(P=0.011),GAS5差异表达并不影响MM患者的预后。结论信息分析学分析方法为lnc RNA研究另辟蹊径,是一种高效可靠的分析方法;同时发现的关键lnc RNA分子CRNDE-h与MM发病密切相关,从而是一种高效敏感的MM血清检测指标,并且其低表达与MM临床特征及不良预后具有直接相关性,也许可作为评估MM预后的重要分子标记和治疗新靶点。
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