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目前荧光分子层析成像通常使用的均匀光学结构背景将会引入光子输运建模上的显著误差，有效的光学结构先验信息对荧光分子层析成像重建精度和灵敏度的提升具有重要意义。光学结构的建立与解剖结构信息的获取密切相关，但常用解剖学成像方式存在成本或者软组织分辨率方面的限制。为了实现目标鼠组织光学结构的在体构建，本文首先将标准数字鼠(Digimouse)模型非刚度配准至目标鼠XCT 图像，实现目标鼠解剖结构图谱的在体获取；其次将目标鼠解剖结构图谱作为硬先验信息引入时域扩散光学层析成像，重建目标鼠的组织光学结构。结果表明，通过非刚度图像配准能够简单易行的实现组织器官在目标鼠XCT 图像上的标识，结构先验信息能够有效提升目标鼠光学参数的重建精度。