甲壳动物亚门包括了许多具有重要的生态与经济价值的物种。随着对甲壳类动物水产品消耗的逐年递增，对甲壳动物的发育，生长与繁殖机制等方面的研究在水产、养殖、物种保育和生态保护等领域都有着重要的作用。在这些甲壳动物的生物过程中，转录因子对基因表达的调控起着非常重要的作用。然而，由于大多数甲壳动物基因组序列的缺乏，对这些物种的转录调控进行全面系统地研究变得极为困难。因此为了填补甲壳动物转录调控研究的空白，我们产生并收集了大量甲壳动物的转录组数据。通过多重生物信息学分析，我们预测了近百个甲壳类物种的转录组中的所有转录因子，并通过研究甲壳动物转录因子在后口动物中的进化关系推测其功能。此外，通过对转录表达数据的进一步研究，我们预测了部分转录因子的下游转录调控网络。这些结果将有助于了解甲壳动物各种生物过程中的转录调控机制，为甲壳动物的研究者们提供丰富的信息以开发可提高虾蟹等经济物种养殖效率的生物技术。