目的:性发育疾病(Disorders of sex development (DSD))是一种染色体、性腺、表型性别不一致的罕见疾病.由于很多性发育相关的基因不仅仅只在性腺中表达,同时会在其它器官中表达,因此这些基因缺陷会导致综合征型DSD.本研究旨在为1例存在原发性闭经、第二性征发育不良和耳朵发育不良的女性患者确定其疾病发生的原因并明确诊断.该患者的父母均无相关的临床表征. 方法:目前常规基因诊断通常是对受检者疾病相关的1个或2个基因采用一代测序的方法,不仅低效,而且比较昂贵、周期长.本研究采用新一代测序技术(NGS)结合目标区域捕获技术,对受检者及其父母的300多个DSD明确致病或者可能致病的基因进行外显子和邻近内含子区域(共1.5Mbp)测序分析,并对发现的候选突变采用Sanger测序进行验证. 结果:本检测在受检者的CHD7基因的34号外显子检出1个杂合突变c.7389de1A(NM_017780.3)，该突变形成截断型蛋白(p.K2464Sfs*39)a高通量测序结果显示该突变有275条reads支持，其中138条read:支持在该位点缺失了1个A碱基。在受检者的父母未检出该突变，Sanger验证结果与新一代测序结果一致。该突变无文献报道，在千人基因组计划数据集和内部的1092对照中也均无记录。CHD7基因有38个外显子，其截断型突变(移码突变、无义突变)会导致CHARGE(眼组织)缺损、心脏畸形、先天性后鼻孔闭锁、生长发育迟缓、生殖器发育不良、耳畸形/耳聋)综合征。该疾病呈常染色体显性遗传，发病率约为0.1-1.2/10,000活产儿。受检者的临床表征符合CHARGE综合征。以上结果表明:受检者的CHD7基因的c.7389de1A突变是导致其催患CHARGE综合征的原因。 结论:综合征型疾病如CHARGE综合征，由于疾病特征通常会与其它综合征重叠，因此比较难实现精确诊断。基于新一代测序技术的诊断性筛查可以辅助临床诊断，并且经济实用、准确、快速。