基于Pac-Bio单分子实时测序技术比较酸马奶和生马奶中细菌多样性

来源 :第十五届益生菌与健康国际研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jiejie2717
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  酸马奶是一种由生马奶发酵而成的乳制品,在蒙古族传统医学中,以其高营养价值和治疗多种疾病而闻名。本研究旨在探讨酸马奶和生马奶中细菌的多样性,特别是乳酸菌(LAB)。从伊犁、哈萨克自治州和新疆维吾尔自治区3 个牧区采集了29 份酸马奶和13 份生马奶样本,通过Pac-Bio 单分子实时测序(SMRT)技术对16S rRNA 全长序列进行测序。
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乳酸菌对人体健康有一定的促进作用,其在各种发酵食品中扮演着极其重要的角色,并且现在已经有许多从发酵食品或人体肠道获得的乳酸菌获得了广泛的应用。植物乳杆菌NCU116 是一株来源于我国传统泡菜当中的典型优势菌株,其已被证实具有调节肠道、缓解便秘等多种益生功效。为了更深入的了解其在特定环境如泡菜和肠道环境当中的适应机制,本文通过比较基因组等方法预测了其胞外蛋白相关的编码基因。
乳酸菌作为一种栖居的适应性微生物,应从同源宿主中分离和鉴定,以提高其作为饲料添加剂的效率.在本研究中,商业猪(CP)、土猪(NP)和野猪(WB)的可培养的乳酸菌含量在4.64~7.39 lg(CFU/g)之间,其中商业猪和土猪粪便中的乳酸菌含量远高于野猪粪便.在商品猪、土猪和野猪粪便中分离鉴定出96 株乳酸菌菌株,其中以肠球菌属、乳杆菌属、片球菌属和魏斯氏菌属的13 种为代表.体外试验包括模拟胃肠
任何菌株作为益生菌的重要的前提条件主要有3 点:一是被机体摄入后能够抵抗一定程度的胃液消化作用,二是保证乳酸菌到达结肠的数量足以定殖,三是能对宿主发挥有益作用。而人源分离的乳酸菌作为具有高度安全性的载体,具有能发展成为优秀益生菌的潜力。因此研究人工模拟胃肠液耐受性,保证菌群在人体内的存活率就变得十分重要。
本实验旨在研究鼠李糖乳杆菌GG 株(Lactobacillus rhamnosus GG,LGG)介导巨噬细胞对前脂肪细胞成脂分化的影响及相关机制,并比较活菌和热灭活菌的作用差异.分别将LGG 活菌和灭活菌(80℃水浴30min)与小鼠巨噬细胞系RAW264.7 共培养24 h,分别采用qPCR 和ELISA 测定白细胞介素-6,10,12(interleukin-6,10,12,IL-6,10,
本研究旨在揭示我国不同发酵蔬菜微生物菌系结构。高通量测序结果表明:厚壁菌门和变形菌门是发酵蔬菜的主要菌门,但其相对含量各不相同;在科水平,乳酸杆菌科和肠杆菌科是发酵蔬菜的主要优势菌科,其中乳酸杆菌科在浆水、无盐腌菜和辣白菜中的相对含量较高,而肠杆菌科在泡菜、有盐腌菜、梅干菜和糟菜中的相对含量较高;在属水平,乳酸杆菌属是发酵蔬菜中含量最高的菌属,沙雷菌属在泡菜、梅干菜和糟菜中的相对含量较高,寡养单胞
金黄色葡萄球菌是人类肠道和表皮常见的共生菌,该菌从肠道向周围器官或组织的转移可引起严重的疾病和并发症.本研究旨在筛选和鉴定对金黄色葡萄球菌在Caco-2 细胞单层中移位有显著抑制作用的乳酸杆菌.首先,通过96 孔板法和粘附法分别获得了对粘蛋白和Caco-2 细胞有较强亲和力的菌株.随后,采用Ussing-chamber 系统进行细菌移位试验,发现2 株发酵乳杆菌对金黄色葡萄球菌CMCC26003
胞外多糖(Exopolysaccharides,EPS)作为乳酸菌(Lactic acid bacteria,LAB)重要的次级代谢产物,在发酵乳制品的生产中发挥着重要的作用.本试验以分离自蒙古国酸牛奶中的1 株高产胞外多糖的嗜热链球菌IMAU20756 为研究对象,采用二代测序技术(Illumina Hiseq 4000)进行基因组测序,找出与EPS 生物合成相关的基因簇,研究发现该菌株基因组全
酸马奶在新疆、内蒙等地区广受欢迎,具有独特的营养保健功效、而且蕴藏着丰富的乳酸菌资源。酸马奶的高营养价值和良好的医用价值与其中乳酸菌的作用密不可分。本文以采集自新疆6 个地区的酸马奶样品为研究对象,对其中的乳酸菌进行分离鉴定,初步筛选出发酵性能较好且具有潜在益生特性的乳酸菌。结果表明:从29 份酸马奶样品中分离得到161 株乳酸菌,对菌株进行形态学观察,16S rDNA 序列鉴定显示,有乳杆菌属、
西撒哈拉首都阿尤恩市属海洋热带海洋气候,干燥、炎热的气候特征和丰富的生物资源必然孕育着丰富的微生物资源,因此本文以采集自阿尤恩地区的自然发酵牛乳为研究对象,采用纯培养方法和宏基因组16S rRNA 基因测序技术揭示阿尤恩地区自然发酵牛乳中乳酸菌多样性,从而达到分离、保藏自然发酵乳中乳酸菌菌种及丰富自然发酵乳中乳酸菌多样性信息的目的。
乳酸菌是公认的对人体有益的微生物,是益生菌筛选的重要来源,拥有丰富、优质的乳酸菌资源对于乳酸菌的基础研究和产业化开发具有重要意义。蒙古国传统发酵乳制品食用历史悠久,其中蕴藏着丰富的乳酸菌资源,近年来大量的研究也发现从传统乳制品中分离的乳酸菌具有重要的生产特性和应用价值。