全国图书馆参考咨询联盟为了适应网络技术、知识产权、参考咨询员要求、读者需求等的发展变化，对联盟的服务也进行了一系列的改革和创新。目前联盟的服务模式有：提供了基于元数据跨库检索技术平台的文献搜索引擎，可对中外文图书、期刊、报纸、学位论文、会议论文、专利、标准、视频等不同类型文献实现“一站式”检索，极大地降低了读者检索不同数据库文献的难度，免除了读者不停地更换数据库进行检索。提供了面向全国的图书馆联合目录及云图书馆文献传递系统，网站访问没有IP限制，实现了向全体人民免费开放服务的宗旨。建立了真正面向全国公共、高校、科研系统图书馆的参考咨询联盟平台，实现了全国公共、教育、科研图书馆的跨系统合作和资源共享。真正实现国家公共文化服务的免费服务政策，加盟图书馆无需购买服务器和软件，就可利用本系统开展网上参考咨询和实时咨询；读者无需注册和认证，即可获免费的文献传递服务。建立了共享与合作机制。建立了规范的质量检查体系。建立了全国图书馆参考咨询联盟管理机制，制订了资源共享政策及配套文件。建立了全国图书馆参考咨询联盟管理中心。