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计算机辅助药物设计技术在越来越多的新药研发项目中得到应用，其中不乏成功的实例。药物化学驱动(或快速跟踪)的新药研发项目，靶标有效性得到一定程度的确证，可利用的信息多，竞争激烈。这样的项目给计算机辅助药物设计带来了巨大的挑战，拥挤专利空间使得分子设计难度加大，竞争激烈对研发时间和效率有更高的要求，竞争对手的项目进展对新设计分子的活性提出了更高的要求等。尝试通过一些案例，讨论如何有效利用已有的信息，将计算机辅助药物设计与多学科的研究基础结合，推动快速获得具有知识产权、可合成性与改造性强和活性优良的先导化合物。