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本研究通过对牛脂肪型脂肪酸结合蛋白基因5’侧翼区的1441bp序列进行SNPs检测，结果在转录起始位点上游,389bp处发现T→C突变，进而利用PCR-SSCP的方法在秦川牛、南阳牛、鲁西牛、夏南牛和郏县红牛共5个牛群体中进行个体基因型分析，结果发现3种基因型，分别命名为AA、AB和BB。x2检验表明，该基因座各品种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。基因型与秦川牛肉用性状的关联分析发现，AB基因型个体的宰前活重、胴体重、含水率均显著低于AA和BB型个体)，AA和BB型个体之间差异不显著；BB型个体大理石花纹等级极显著优于AB型个体，显著优于AA型个体。推测这一位点可能是影响牛肉大理石花纹及含水率的主效OTL或与之紧密连锁，可尝试做为肉牛肉质性状的候选分子标记。