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本文简单介绍了查尔酮合酶(CHS)的化学性状和特点，论述了查尔酮合酶基因经重复-歧化以后的3种遗传学效应，包括假基因化、亚功能化和性功能化，分析了新功能化的基因超家族成员系统的发育，包括：1、在科水平，同科植物的超家族成员与同科植物的CHS聚类在一起；2、在科以下水平(种/属)，不同种/属的超家族成员聚成独立一支。探讨了新功能化CHS基因超家族成员的功能。