基于4种线粒体基因序列的南雄农区鼠形动物DNA条形码分析

来源 :病虫防护与生物安全——中国植物保护学会2021年学术年会论文集 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lichlei
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鼠种的分类是研究鼠类种群和群落特征的基础,是科学治理鼠害的前提,对鼠传疾病的监测与防控也具有重要意义。为了弥补传统形态鉴定的不足,本研究利用4种线粒体基因对广东省南雄市农田害鼠进行鉴定,探讨不同条形码基因应用于鼠种鉴定的可行性。2019年在南雄市珠玑镇农田捕获110只鼠形动物样本,对部分样本通过提取基因组DNA、通用引物扩增COI、Cytb、16S rRNA和D-loop基因片段及测序,经同源性比对、遗传距离分析和系统发育树构建鉴定鼠种,并与传统形态学鉴定结果进行比较。结果表明,所测样本隶属于2目3科4属6种,分别为黄毛鼠、黄胸鼠、大足鼠、板齿鼠、卡式小鼠和臭鼩鼱。其中臭鼩鼱COI、D-loop基因不能扩增出条带,臭鼩鼱Cytb序列、黄毛鼠16S rRNA序列不能正确比对。不同鼠种及不同基因种内遗传距离均小于种间遗传距离。系统发育树显示,同一鼠种均聚为一支,支持率在99%以上。综合分析发现,DNA条形码技术是传统形态学鉴定的有力补充,能够纠正形态鉴定的错误,在应用时,依据数据库的完整性和准确性合理选择DNA条形码,且利用多基因相互验证保证鉴定结果准确。
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