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为了研究若尔盖高寒湿地水中的细菌群落结构多样性，2007年8月到该湿地进行了考察、采样，实地测定了采样点的地理参数和天气特征，回到实验室检测了部分水质指标。结果显示，80％以上的检测项目处于地面水国家Ⅱ类到Ⅴ类标准之间，COD值较高。通过化学方法提取了水中的细菌基因组总DNA，用16S rDNA通用引物F357-GC和R518进行PCR扩增，得到长度大约为230 bp的产物，再经DGGE分离，获得细菌群落DNA特征指纹图谱。结果表明，6个样品的条带数量从17到22条不等，平均达到19条，细菌群落多样性较高。其中，花湖样品的多样性多于保护站。花湖的4个样品相互之间相似性较高，保护站2个样相似性较高，花湖和保护站之间相似性较低。这种结果主要是由于花湖和保护站之间水环境上的差异造成的。
6个样品存在一些各自的特有种属和共有种属。