芽胞杆菌资源多样性研究与应用，通过采集中国不同生境的芽胞杆菌，建立了芽胞杆菌土壤资源库9000多份，分离保存芽胞杆菌菌株25000多株；分析了120种芽胞杆菌物质组和脂肪酸组，分析了98种芽胞杆菌酶学特性，实施了180种芽胞杆菌全基因测序计划，整理了芽胞杆菌文献，给出753种芽胞杆菌中文学名，发现了50多个芽胞杆菌潜在新种，已经发表了五个新种。通过新种采集分析生境分布多样性，通过16S rRNA分化研究揭示遗传分化多样性，通过台湾芽胞杆菌的调查分析地理分布多样性，通过武夷山芽胞杆菌的调查分析垂直分布多样性。利用宏基因组分析发酵床微生物群落分布多样性，发现每克垫料超过4500 OUT微生物，对于猪粪的分解和猪病原的抑制起到重要作用。利用芽胞杆菌资源，开发出果品微生物保鲜剂，种苗调运保鲜剂，饲用益生菌和环境益生菌，进入应用示范。