芦笋基因组计划国际合作项目由陈光宇博士于2009年在秘鲁举行的第12届国际芦笋大会提出后，得到了积极的响应。江西省农业科学院联合深圳华大基因研究院、美国乔治亚大学、中国科学院植物研究所、中国热带农业科学院以及意大利国家蔬菜研究所等多家单位于2010年底启动了国际芦笋基因组计划，开展芦笋全基因组测序。陈光宇博士担任该项目首席科学家，深圳华大基因研究院承担基因组测序和组装等技术工作。芦笋基因组采用全基因组鸟枪法(WGS)策略，以雄性双单倍体为测序材料，利用第二代测序技术——从头测序(De-novo sequcncing)方法进行，并将对雌性双单倍体材料进行重测序。根据芦笋基因组的重复序列等组分的具体特点，搭配不同长度的DNA插入片段进行双末端测序以便跨过更多不同长度和相似度的重复序列，通过对单碱基的高深度重复测序，提高单碱基质量。目前已成功完成了芦笋基因组鸟瞰，覆盖深度达到40倍，并获得20 Gb的基因组原始测序数据。测序初步结果表明，芦笋基因纽相对较大(1229 Mb)、杂合率低、重复序列多、GC含量略高。现在正在构建20 Kb大片段BAC克隆对其进行测序和组装。测序最终目标是完成芦笋基因组精细图绘制、基因组注释、比较基因组及进化分析，为芦笋分子育种及基因功能研究开辟新途径。从分子角度解码芦笋生命，阐明其生长、发育、抗病、抗逆、高产及药用成分形成和作用机制的芦笋后基因组时代即将到来。