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布鲁氏菌是世界范围内广泛分布的、人畜共患病的重要病原体之一。目前广泛使用的布病疫苗在免疫原性和生物安全方面均存在严重缺陷，无法将自然感染与疫苗接种的动物相区别，使得布病难以在畜群中彻底根除。代表性差异分析(RepresentationalDifferenceAnalysis，RDA)通过差减杂交与PCR巧妙结合，特异性使靶序列在三轮杂交后富集100万倍以上。本研究运用PDA技术，以流产布鲁氏菌(B.abortus)544A强毒株和流产布鲁氏菌(B.abortus)104M弱毒株为样品来源，经三轮差减杂交和PCR富集，将差异片段克隆测序，最终得到在强毒株中缺失的三条差异序列，经验证确定此差异序列确实来源于流产布鲁氏菌104M弱毒株。结果分析这些差异序列为具有相当毒力基因功能的已知基因和可能与毒力相关的基因。对这些差异基因的功能研究为布鲁氏菌自然感染与疫苗接种鉴别诊断技术的建立奠定了基础。