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运用逻辑分析等方法,对闽台学生体质健康(体适能)监测机制与同类指标进行对比分析,研究认为:闽台两地学生体质健康(体适能)监测体系各具特色,台湾省实施效率不如福建省;闽台两地学生体质健康(体适能)监测任务均是以获取学生若干指标,了解掌握指标的发展,纵横向比较、区域比较指标差异,为相关管理部门提供决策依据为主要任务;闽台学生体质健康(体适能)评分(等级)标准中,台湾按年龄对照等级更为准确;台湾省男、女生身高在高中、大学阶段逐渐高出福建学生;根据闽台学生身体质量指数常模比较,认为台湾学生超重现象严重;可比性的同类指标比较显示,台湾学生身体素质弱于福建省学生;台湾职能部门在对学生体适能的干预过程,虽然管理层想尽了办法,做了大量的投入,但效率、结果仍不尽人意;闽台学生体质健康(体适能)监测交流合作是非常必要的,联合两岸管理层和社会力量,逐步建立跨越闽台的监测、调研、实施的联合机制是必要且可行。