药物-机体相互作用形成的复杂巨系统之复杂性造成效应物质难以辨识问题不仅严重阻碍了新药研发的进程，也给现代分析技术带来了巨大的挑战。针对上述难题，本研究团队基于钱学森的开放复杂巨系统、Prigogine的耗散理论、Harken的协同理论及上述复杂巨系统的特点，提出并建立了药物-机体开放复杂巨系统的因果相关数理模型，分析药物-机体复杂巨系统中数据所蕴涵的元素间的双向因果关系，进而对上述因果关系的强弱进行定量刻画及统计处理，获得上述复杂巨系统中效应物质群；发展了靶-药识别组合受体色谱功能辨识技术，对上述复杂巨系统中的复杂活性信息进行准确分析及特异性活性筛选，结合化学分子结构辨识及生物活性功效辨识，完成核心效应物质的精筛，从而构建了中药有效成分群辨识技术体系；进而完成了丹参-冰片、丹参-降香等“良关系”药对体内代谢逻辑网络及核心效应物质研究，借助微透析实时、动态、原位取样优势，开展了香丹注射液在大鼠脑内的药-时序列代谢分析，筛选、发现、确证了核心效应物质—丹参素异丙酯，药理药效学研究表明其具有显著的抗心肌缺血和脑缺血、抗神经炎症等活性。基于此，创制了4类防治心脑血管1类化学新药候选药物，为中医药分子化、数字化及开展以中药为源泉的安全、优效、可控的新药创制提供一种全新研究思路，为基于体内核心效应物质的复方丹参方、香丹注射液等临床常用药物的二次开发奠定基础，为进一步阐释和刻画中医药保健、预防、治疗机制提供一种全新的策略。