小柴胡汤组方严谨,临床疗效确切,由于各种致病因素的增多,个人体素质差异日趋复杂,疾病的病因、病机也变成错综复杂,不少疾病往往寒热、虚实错杂、气机逆乱,很难用单一治法去组方治疗,而小柴胡汤刚好能发挥这方面的优势.小柴胡汤及其变方治疗的病症的确不少，在这里也仅举胆汁反流性胃炎、消化性溃疡和功能性消化不良比较典型的病例，在平时必须按中医学辨证论治的治疗原则来应用。具体说来有以下几个方面:一是具备小柴胡汤证，这是应用本方的基本指征。这些指征即可出现于表证，也可出现于里证、半表半里证。要按辨证论治的治疗原则，遵仲景“但见一证便是，不必悉具”之旨。其二，不要拘泥于原方。张仲景立小柴胡汤，寒温并用，攻补兼施，达到通利三焦，调达上下，宣通内外，和畅气机的目的。方中药物变化可以根据疾病的变化，按其性味功效随证加减。其三，合其它方药随证化裁加减，灵活应用。方剂是治法的具体体现，小柴胡汤“和法”本质就是融各种方法于一方。所以在临床运用中可以根据病情需要，合其它方，甚至数方于一方，充分体现小柴胡汤组方特点。