线粒体基因组中最长保守序列的分析及其意义

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在生物信息学中,寻找核苷酸和蛋白质序列中模式(pattern)极为重要,许多模式通常具有重要的结构和功能,一般认为它们是在进化过程中保存下来的,因而更可能在生物序列中出现,在核苷酸和蛋白质序列中找出它们可以帮助决定序列的功能以及阐明序列间的进化关系[1].现在已经有几种算法来处理这类问题,如Pratt,Splash,和Meme[3].本文介绍另外一种算法,并将它用于64条线粒体全基因组的研究,得到了一些有意义的发现.
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