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本文基于前期的根瘤菌遗传多样性和生物地理学研究,从1000余株大豆根瘤菌中选取了26株Sinorhizobium和Bradyrhizobl二两属代表菌株,进行了比较基因组学分析,发现:1)两属根瘤菌各自特有功能基因与它们的生物地理分布特征相符;2)己知功能基因(包括共生及环境适应基因)在各基因组中的有无特征可以反映根瘤菌的物种系统发育关系,而根瘤菌的泛基因组相关信息则不能正确反映这种关系;3)遗传重组和水平基因转移在核心基因组的进化历史中发挥了主导作用。