低盐度胁迫下凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的转录组学分析

来源 :第十一届长三角科技论坛水产科技分论坛暨2014年上海市渔业科技论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chengbocc
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  凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)作为一种广为人知的广盐性对虾品种.由于凡纳滨对虾幼虫阶段发生在海洋中,而后期幼体则在海岸地区成长为成体,因此凡纳滨对虾在个体发生阶段经历一个由高盐度环境到低盐度环境的过程.这一个体发生过程展示了一个高-低-渗透压调节模式以及低盐度胁迫的一个耐受能力,不过较少的有报道关于幼虾应对低盐度环境波动时的策略.为了探讨长期低盐度环境下的不同生理调节作用,将幼虾(1.98 ± 0.28 g)直接暴露在3psu 和30psu 的盐度环境下进行一个为期八周的实验,并观察评估这两个盐度对凡纳滨对虾幼虾的生长的影响.采用高通量测序技术,并用转录组学分析来比较在低盐度环境下不同的生理调节.通过使用Illumina HiSeqTM2000 分析,获得了26034 条差异基因,其中有855 条基因在应对低盐度环境时发生了显著性的表达变化.一些显著变化的通路被用于分析不同环境盐度下对生理调节的影响.此外,在分析结果之前,仍需做一个数据的验证.在显著变化的通路当中随机挑选20 条基因用于验证实验,结果表明该de novo 测序十分精确可靠(相关系数为0.91).凡纳滨对虾转录组的结果将为渗透压调节功能的研究提供一些有用的信息.
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