葡萄座腔菌科(Botryosphaeriaceae)真菌广泛分布于世界各地,其种类繁多,寄主植物多种多样,既可作为病原菌引起树木溃疡病,又能作为内生真菌潜伏在寄主植物组织中。杧果流胶枝枯病是我国杧果种植区的常见病害,各地均有发生。该病可由葡萄座腔菌属的Botryosphaeria rhodina(无性型:可可毛色二孢Lasiodiplodia theobromae,原名可可球二孢Botryodiplodia theobromae),B.dothidea(无性型:七叶树壳梭孢Fusicoccum aesculi)和B.parva(无性型:小新壳梭孢Neofusicoccum parvum)引起,其中主要病原是可可毛色二孢。在研究杧果流胶病菌的过程中,我们发现可可毛色二孢对枝条和果实的致病力最强,而七叶树壳梭孢和小新壳梭孢致病力相对较弱,此外,我们还发现这3种病原菌均可在人工培养基上产生子囊壳、子囊及子囊孢子。基因组测序有助于深入了解病原菌致病机理及其生活史,而目前未见杧果葡萄座腔菌基因组测序的报道。为此,本研究采用Illumina技术对杧果葡萄座腔菌属的可可毛色二孢、七叶树壳梭孢和小新壳梭孢进行全基因组测序,运用3种专业软件ABYSS,SOAP,VELNET进行组装,结果表明,可可毛色二孢基因组大小为43.8Mb,N50为637kb,七叶树壳梭孢基因组大小为45.6Mb,N50为583kb,小新壳梭孢基因组大小为43.8Mb,N50为503kb。采用Augustus基因预测软件对组装的结果进行编码基因预测,分别从可可毛色二孢、七叶树壳梭孢和小新壳梭孢基因组预测出12 953个、13 144个和13 258个编码基因。通过同源比对,从杧果流胶病菌的3个菌株基因组序列中均可找到MAT1-1和MAT1-2交配型基因,下一步将继续研究杧果葡萄座腔菌交配型基因位点及其功能。