数字PCR技术在槟榔黄化植原体检测上的应用前景分析

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黄化病是一种严重制约中国和印度槟榔产业发展的致死性病害。在中国,有学者提出植原体为该病的病原之一,然而受植原体无法人工培养、槟榔不能嫁接等因素制约,国内尚未完成柯赫氏法则验证(通过间接方法),故学界对该结论争议较大;此外,槟榔黄化植原体(Arecanut yellow leaf phytoplasma,AYL)检出率不足的缺点也是争论的焦点之一。AYL需用巢氏PCR扩增其产物才能满足测序要求,由此可见其含量非常低。车海彦采用Real-time quantitative PCR (qPCR,第二代检测技术)对槟榔不同部位进行了检测,结果显示花苞、心叶、第2片叶、第3片叶、第5片叶、根的检出率分别为100.00%、80.00%、26.7%、46.7%、60.00%、0。由此可见,AYL分布不均。上述两点严重地制约着AYL检出效率。目前,如何提高AYL检测灵敏度已成为亟待解决的问题。2011年面世的第三代检测技术-微滴式数字PCR (Droplet digital PCR,dPCR)克服了qPCR检测灵敏度、精确度受限制的缺点。迄今,该技术现已成功应用于植物病原菌、农业以及医疗系统检测。Bahder等于2018年首次用该技术对椰子、海枣等棕榈植物病原植原体进行了检测研究,结果显示dPCR较qPCR灵敏度更高。我们正尝试将dPCR技术引入AYL检测,该技术有望解决检出率低的难题,也有助于槟榔黄化病早期检测及防控并为AYL病原说提供更多有力的证据。
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