功能化碳纳米管吸附溶菌酶的分子动力学研究

来源 :北京化工大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:wangchun2000
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溶菌酶在生物医药领域有广阔的应用前景,但游离的溶菌酶性质不稳定,分离困难,将溶菌酶固定在载体上可以提高溶菌酶的稳定性,延长使用时间,方便分离和重复利用。采用阴离子表面活性剂十六烷基硫酸钠(SCS)功能化的碳纳米管作为固定溶菌酶的载体,可高效吸附分离溶菌酶,实现溶菌酶的固定化。溶菌酶在固体表面吸附有很多影响因素,了解溶菌酶的吸附对于溶菌酶的应用有重要的意义。本文通过分子动力学模拟,研究溶菌酶在功能化碳纳米管表面的吸附取向、吸附机理以及功能化碳纳米管与溶菌酶之间的相互作用。主要研究内容及结论如下:确定了溶菌酶(HEWL),十六烷基硫酸钠(SCS),碳纳米管(CNT)和异丙醇(IPA)的力场参数。对SCS功能化碳纳米管进行了模拟;对溶菌酶进行了预处理,使溶菌酶表面带电情况与在实验条件下一致。根据碳纳米管和溶菌酶表面的带电情况,选择了7个最有可能的吸附构象,进行分子动力学模拟。对模拟结果从均方根偏差(RMSD),回转半径(g(r)),残基均方根波动(rmsf),二级结构,吸附取向变化和吸附能量方面进行了分析。结果表明:溶菌酶倾向于以C,N端面(位于α域)吸附在功能化碳纳米管表面,因为溶菌酶在吸附过程中会不断旋转和调整位置,SCS头部带负电,所以带正电荷较多的溶菌酶的C,N端面更容易吸附到功能化的碳管的表面。C端部分二级结构变化较为明显,有部分α-螺旋丢失。根据平均力势(Potential of mean force, PMF)的计算结果,从热力学的角度分析了溶菌酶的吸附过程,并分析了体系中每个组分的焓变和熵变对吸附过程的贡献。结果表明:溶菌酶在功能化碳纳米管表面的吸附是自发的。吸附过程中,溶菌酶先以C,N端面吸附在SCS表面,然后继续向SCS表面靠近,最终以平躺的形态吸附在功能化碳纳米管表面。
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