2010年4月26日，五部委联合发布的《企业内部控制审计指引》，标志着内部控制审计成为了一项新兴的审计业务。指引的颁布为内部控制审计的实施提供了框架结构，但是并未出具相应的内部控制审计准则进行深入的说明，这为即将全面实施的内部控制审计带来了困难。本文以《企业内部控制审计指引》为基础，借鉴了美国在成功实施内部控制审计与财务报表审计整合方面理论和实践的经验，对财务报表审计和内部控制审计的相关概念进行了阐述，并以整合的理念为基础，对两种审计业务整合的理论分析和实施过程进行了阐述。本文首先介绍了财务报表审计和内部控制审计的概念及其要素，回顾了美国和我国的内部控制审计的产生和发展历程。在借鉴美国内部控制审计发展经验的基础上，本文提出了内部控制审计与财务报表审计整合即整合审计的概念，即由同一家会计师事务所同时执行被审计单位的内部控制审计与财务报表审计业务。然后，依据对两种审计业务基本理论的描述，比较了内部控制审计与财务报表审计的相同点和不同点，并以此为基础分析了内部控制审计与财务报表审计整合的可行性和必要性。最后，本文在以上理论分析的基础上，确定了关键的整合点，并以此为核心构建了整合的全部流程。内部控制审计与财务报表审计整合实施主要包括计划审计阶段、实施审制阶段、评价控制缺陷、出具审计报告四个阶段。具体来说包括以下步骤：计划审计阶段的初步业务活动以及制定整合审计计划；实施审计阶段的风险评估程序、选择拟测试的控制、控制测试、实质性程序和对舞弊风险的考虑；评价控制缺陷；出具审计报告。