【摘 要】
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目的:qRT-PCR检测的准确性高度依赖于可靠的内参基因,然而在肺鳞癌细胞中许多常用的内参基因表达并不稳定,因此不适合于量化和标准化qRT-PCR数据。本研究的目的是在肺鳞癌中确
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目的:qRT-PCR检测的准确性高度依赖于可靠的内参基因,然而在肺鳞癌细胞中许多常用的内参基因表达并不稳定,因此不适合于量化和标准化qRT-PCR数据。本研究的目的是在肺鳞癌中确定新的可靠的内参基因。材料和方法:采用RNA测序技术,检测5例正常组织和44例肺鳞癌组织全基因组表达情况。检测了15个常用的内参基因的表达情况,以及确定了五个候选内参基因。为了验证RNA测序结果,我们用qRT-PCR检测另外100对正常肺组织和肺鳞癌组织中这20例基因的表达情况,然后用geNorm和NormFinder分析结果。结果:在15例常用的内参基因中有14例(B2M, GAPDH, GUSB, HMBS, HPRT1, IPO8, PGK1, POLR2A, PPIA, RPLPO, TBP, TFRC, UBC, YWHAZ)表达水平太低,以致不能容易地检测到,或表达水平在正常组织与肿瘤组织之间存在较大差异,甚至相同组织类型也存在较大的表达差异。与此相反,15例常用内参基因中有1例内参基因(ACTB)和5候选内参基因(EEF1A1, FAU, RPS9, RPS11和RPS14)在所有样品中稳定的高表达。结论:ACTB, EEF1A1, FAU, RPS9, RPS11和RPS14是肺鳞癌qRT-PCR理想的内参基因,而另外14种常用的qRT-PCR内参基因可能并不适宜。
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