目的:通过对湖北省武汉和咸宁地区野生刺猬携带的病毒、细菌、寄生虫等病原体种类进行检测,了解该地区刺猬携带病原体的种类特性和流行病学特征,扩展各类病原体的宿主范围,为当地人畜共患传染病的预防和控制提供理论依据。方法:2018年5月和10月,在湖北咸宁地区进行刺猬样本采集。2019年4月,在武汉地区进行刺猬样本采集。在采样地点设置肉食诱饵,并用捕动物网手动捕获刺猬后用形态学观察法对刺猬种类进行鉴定。解剖刺猬收集心、肝、脾、肺、肾、肠和血液样本,提取组织DNA和RNA,采用核酸检测方法检测刺猬中冠状病毒、汉坦病毒、贝氏柯克斯体和肠道寄生虫的携带情况,并用血清学检测方法检测刺猬血清样本中的汉坦病毒Ig G抗体。对PCR扩增阳性样本进行测序及进化分析,并对贝氏柯克斯体和毕氏微孢子虫进行基因分型。结果:1.冠状病毒:在捕获刺猬的肠道样本中共有3个样本检测出冠状病毒阳性,总核酸阳性率为5.9%（3/51）。其中2个阳性样本来自咸宁,1个来自武汉地区。所获得的序列最接近在广东省捕获的刺猬中发现的冠状病毒HKU31。系统进化分析显示本次研究中发现的刺猬冠状病毒序列在分类上属于Betacoronavirus属的Merbecovirus亚类,与其他在德国、英国等地刺猬中发现的冠状病毒聚为一支。同时,刺猬冠状病毒分支与蝙蝠中携带的SARS样冠状病毒、MERS样冠状病毒以及武汉海鲜市场肺炎病毒处于邻近分支。2.汉坦病毒:血清学检测结果显示咸宁地区采集刺猬中有10个样本检测出汉坦病毒抗体阳性,而武汉地区采集的刺猬中有2个样本检测出阳性,抗体阳性率分别为27.8%和20%。总体汉坦病毒抗体阳性率为26%（12/46）。春夏季节的抗体阳性率高于秋冬季节的抗体阳性率。3.贝氏柯克斯体:在捕获刺猬的脾样本中共有5个样本对贝氏柯克斯体呈PCR阳性,刺猬中的核酸阳性率为12.2%。MST结果揭示了刺猬中的贝氏柯克斯体为新基因型,并且这两个新的序列类型聚集在系统进化树的同一分支上,系统关系最近的序列类型为MST2。基于icd基因的系统发育分析表明刺猬中发现的贝氏柯克斯体分类于类群Ⅱ,与一组来自慢性Q热病患者和哺乳动物的毒株相似。4.毕氏微孢子虫:PCR扩增结果显示在刺猬肠道样本中检测到毕氏微孢子虫的核酸阳性率为9.8%（4/41）,四个阳性样本序列（EA1、EA2、EA3和EA4）属于四个新的基因型,与从中国的狐狸中检测到的一个基因型为type IV的序列最为接近。基于ITS序列的系统发育树表明,本次研究中发现的几个基因型聚集在一个分支上,且在分组上属于1c组。结论:研究发现武汉和咸宁地区野生刺猬能够携带多种病原体,对冠状病毒、贝氏科克斯体和毕氏微孢子虫的感染率较高,并且在春夏季刺猬中汉坦病毒的抗体阳性率很高。刺猬中携带的这些病原体具有较高的基因多样性,与之前已发现的毒株有一些差异,且多为对人类具有潜在致病性的基因型,存在人群感染风险。因此,应加强对刺猬等野生动物的监测和流行病学调查研究。