本文研究的目的，主要是探究高管的股权激励、薪酬激励与内部控制的有效性之间的关系。以确定合理的高管激励机制，实现对上市公司高管有效的激励和约束，使得高管目标与企业目标一致，减少企业的代理成本，促进内部控制的有效实施。本文首先采用理论分析的方法，基于现代企业理论中契约理论、委托代理理论、激励理论等理论，结合内部控制的本质与结构，讨论高管股权和薪酬激励对内部控制有效实施的影响机理，并在此基础上提出假设。然后采用实证分析的方法，使用目标导向下的内部控制评价体系，收集样本公司的数据，计算出了样本公司内部控制的有效性得分，完成对内部控制有效性的综合评价。最后，在理论分析的基础上提出研究假设。选取具有代表性的样本公司，及其内部控制有效性得分，收集高管薪酬和持股的样本数据，进行描述性统计，同时选择其他对内部控制有效性有重要影响的因素作为控制变量，构建多元线性回归模型，进行回归分析和假设检验。最后得出实证结论。即上市公司的高管持股比例与内部控制有效性得分存在显著的正相关关系。上市公司的高管年度薪酬与内部控制有效性得分不存在显著的正相关关系。对非国有上市公司实施了股权激励的情况下，高管持股比例与内部控制有效性得分存在显著的正相关关系，而国有上市公司则不存在。实证结果充分的说明了高管激励机制尤其是长期激励机制可以促进内部控制的有效性。其中与基本工资和年度奖金等传统薪酬机制相比，股票和期权这种长期激励机制的激励效果更好。而随着股票和期权等长期激励机制使用规模的扩大，整体薪酬业绩弹性增大，整体薪酬的激励效果增强。这是因为实施股权激励是对高管分配一定的剩余索取权的安排，代表了股东和经营者共同分享剩余。这种安排是一种最优的所有权安排，可以有效促进高管与股东利益趋同，使得高管利益与（股东）企业目标一致，减少高管对股东利益的侵害，减少代理成本，实现内部控制的有效性。