几种手性药物色谱保留行为的预测和一种儿茶素与生物大分子及β-环糊精相互作用的研究

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由于蛋白质手性固定相高效液相色谱柱价格昂贵,使用寿命短的局限性,使它难以被推广。我们提出了用计算模拟的方法在进行对映体分离实验前,先进行对映体的辅助初选,将可能提高柱子的利用率并节省成本。(-)-表没食子儿茶素没食子酸酉旨((-)-epigallocatechin gallate,简称EGCG)是当今极具开发价值的一种抗癌药物。研究显示脂肪酸(FA)与人血清白蛋白(HSA)结合时,可改变药物与HSA的结合性质,因此,在研究药物与HSA相互作用时,考虑FA的影响是至关重要的。DNA是抗癌药物进入生物体内的主要靶标,研究抗癌药物与DNA的相互作用机制,有助于从分子水平上了解抗癌药物的作用机理。EGCG直接服用可能很快在体内被分解,无法发挥原有药效。β-环糊精可与大量有机小分子形成包合物,包结后可以改变小分子的某些理化性能。研究环糊精对EGCG的包合作用机理,能够为EGCG的改性研究提供参考及思路。在此基础上主要开展的工作如下:1.分子对接预测几对手性化合物在蛋白质固定相色谱柱上的保留行为利用分子对接技术预测了2种蛋白质固定相分别与4对手性化合物的相互作用情况。结果表明,预测结合自由能(△G)的大小与对映体(R-(+)型和S-(-)型)的出峰顺序一致;结合自由能差值的绝对值(△(△G))的大小与实验分离因子(α)大小顺序一致。这说明分子对接可以反映蛋白质对不同的手性化合物的识别能力和化合物R-(+)型和S-(-)型的出峰顺序。2.(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯与结合脂肪酸的人血清白蛋白的相互作用——柔性对接研究为了解FA对EGCG与HSA的相互作用的影响,本文采用柔性对接技术对配体(EGCG及其结构片段(-)-表没食子儿茶素(EGC)和没食子酸(GA))与受体(结合脂肪酸和未结合脂肪酸的人血清白蛋白)的相互作用进行预测。结果显示脂肪酸存在时,在位点1HSA与EGCG的结合能力明显减弱;而在位点2HSA与EGCG的结合能力明显增强,且EGCG的对接姿势被原位旋转180。。研究还发现EGC不仅是决定EGCG结合模式的核心结构,而且对结合能有重大贡献;GA仅对结合能具有重要贡献。3.光谱法及分子对接研究(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯与DNA的相互作用用紫外及荧光光谱法对EGCG与DNA的相互作用情况进行了初步的探究,并辅以对接模拟。实验结果表明,在本实验条件下,EGCG可以与DNA相互作用形成复合物,并以沟槽模式结合;复合物形成主要是受氢键和范德华力驱动的自发反应过程。模拟的结果与实验一致,且显示出EGCG以小沟槽模式结合在DNA的G-C富裕区。4.光谱法及分子对接研究(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯与β-环糊精的包结作用运用紫外、傅里叶变换红外(FTIR)、荧光光谱法和分子对接技术研究了β-CD对EGCG的包结机理。紫外和荧光研究表明,EGCG与β-CD可形成包结比为1:1的包结物;包结物形成主要是受疏水作用力驱动;在pH值为7.4的Tris-HC1缓冲溶液中,24℃时包合物结合常数Kc为1025L/mol。FTIR分析表明,EGCG分子完全被β-CD包合。对接模拟结果与实验一致,并将包合物的预测的微观构象可视化。
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