普通菜豆SSR分子标记鉴定体系的建立及应用

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普通菜豆(Phaseolus vulgaris L.)是我国主要食用豆类之一,近年来普通菜豆新品种选育数量呈现出持续上升的趋势,而市场上普通菜豆同种异名、同名异种的现象也日益严重,同时随着我国新品种保护事业飞速发展,申请新品种保护权的普通菜豆数量也逐年增加。因此,对普通菜豆品种快速鉴定和DUS测试的效率也提出了更高要求。在此背景下,建立一套可靠的品种鉴定体系对于规范普通菜豆种子市场、保障普通菜豆产业健康发展显得尤为重要。本研究以SSR分子标记为基础,建立了普通菜豆品种鉴定体系及品种指纹数据库,旨在为普通菜豆品种真实性鉴定提供强有力的技术支撑,为DUS测试辅助筛选近似品种提供一种快速、可靠的途径。以品种DNA分子数据库为基础,对菜豆DUS测试指南中的标准品种遗传多样性做出评价,为DUS测试指南的修订提供分子标记层面的参考依据。本研究所得主要结果如下:1、建立了普通菜豆SSR分子标记鉴定体系及品种指纹数据库筛选出33对在菜豆基因组上均匀分布、多态性较高的核心引物,建立了普通菜豆SSR标记品种鉴定体系和161个品种的SSR指纹数据库。该套核心引物能将数据库中的140个普通菜豆品种鉴别开,并能根据种质来源对品种进行聚类,将亲缘关系较远的品种区分开,将亲缘关系近的品种聚类在相同或相近的类群中。该品种鉴定体系和SSR指纹数据库能为菜豆品种真实性鉴定提供有力支撑。2、评价了SSR指纹数据库辅助筛选DUS测试近似品种的可行性对4个已授予新品种权的普通菜豆品种及它们在DUS测试中选用的近似品种的遗传多样性进行分析,结果显示:授权品种间的遗传距离较远,但授权品种与其近似品种的遗传相似系数较高,且遗传相似系数高的品种间植物学性状也更为相似。对7个核心引物未鉴别开的品种田间DUS测试结果也表明:遗传相似系数为1的品种间植物学性状也极为相似。上述结果说明,通过SSR指纹数据库筛选近似品种与利用已知品种表型数据库筛选近似品种的结果是一致的,也进一步验证了该指纹数据库可以用于辅助筛选DUS测试近似品种。3、分析了菜豆DUS测试指南中标准品种的遗传多样性以建立的普通菜豆SSR指纹数据库为基础,对菜豆DUS测试指南中26个标准品种的遗传多样性进行分析。结果显示:26个标准品种中多数品种间的遗传距离较远,遗传多样性丰富,标准品种选择较为合理。其中仅‘双阳大花皮’和‘大家花雀蛋’两个品种间的遗传相似系数大于0.8,且二者在测试指南中均只指示一个性状,可以根据这一结果开展进一步田间对比试验,尝试减少标准品种数量,进一步提高DUS测试效率。
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