高等级浆液性卵巢癌的免疫原性的研究

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免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)治疗的结果在一些肿瘤的治疗实践中表现出的结果并不理想,高级别浆液性卵巢癌(High-Grade Serous Ovarian Carcinomas,HGSOCs)就是其中之一。这迫使人们探索开发可行的生物标志物,以确定可能产生应答的治疗候选者和指导高级别浆液性卵巢癌群体中精准的免疫治疗。免疫治疗的效果与肿瘤的免疫原性息息相关,所以进一步了解高级别浆液性卵巢癌的肿瘤免疫微环境(tumor microenvironment,TME)特点可以帮助实现新的生物标志物的探索和免疫治疗方法的进一步完善。  目的:  了解分析高级别浆液性卵巢癌的肿瘤免疫微环境特点,寻找新的可以预测其免疫治疗效果/免疫原性的生物标志物。  方法:  在此,我们从TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)公共数据库中下载了高级别浆液性卵巢癌患者的基因组数据,以描述其肿瘤微环境的免疫表型。同时下载的还有与其他五种已被FDA(Food and Drug Association,美国食品药品管理局)批准实行免疫检查点抑制剂治疗的实体肿瘤的数据。通过几种实体瘤免疫微环境的主要免疫相关分子、总突变负荷(total mutation burden,TMB)的横向比较,以及利用单样本基因探针富集分析(single sample Gene Set Enrichment Analysis,ssGSEA)方法对高级别浆液性卵巢癌的肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrated lymphocytes,TILs)水平进行分析,观察高级别浆液性卵巢癌的独特性质。通过基于多决策树的随机森林机器学习方法,我们试图寻找对高级别浆液性卵巢癌根据免疫原性进行样本分类,同时筛选出了决定高级别浆液性卵巢癌免疫原性的十个最主要的因素(包括特定分子、基因、相关信号通路),以此寻找对免疫治疗有指导意义的新的生物标记物。  结果:  同其他几种研究的实体瘤相比,我们观察到高级别浆液性卵巢癌PD-L1、 TMB和细胞杀伤物质均处于最低水平。令人惊讶的是,TMB并不总是与抗肿瘤免疫反应有相关性,正如它在以前的临床试验中未能预测相当一部分患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应。有趣的是,带有BRCA1突变的肿瘤无论在上述筛选出的十个因素的表达,还是已有的实体瘤免疫评估因素的表达上,都表现出了较高的水平,呈现出了较强的免疫活跃表型,并且该表型独立于TMB的影响。综上所述,我们的研究结果提供了证据,证明BRCA1突变可以作为指导高级别浆液性卵巢癌患者免疫检查点治疗等的预测生物标志物。
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