灰葡萄孢中甲基化相关基因的功能研究

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灰霉病是一种由葡萄孢属真菌引起的重要病害,其中灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的寄主范围最为广泛,可侵染200多种植物,每年造成严重的经济损失。表观遗传在动植物的生长发育过程中发挥重要的调控作用,我们通过氨基酸序列比对发现灰葡萄孢中存在三个分别编码DNA甲基转移酶、HP1(异染色蛋白1)和H3K9甲基转移酶的基因BC1G12419、BC1G06432和BC1G11188,分别命名为Bcdim-2,Bchp1和Bcdim-5,对三个基因的功能进行了初步研究,取得如下结果:1.Bcdim-2基因开放阅读框4125bp,含有4个外显子,3个内含子,编码1025个氨基酸,含有DNA甲基转移酶保守结构域;Bchp1基因开放阅读框1118bp,含有6个外显子,6个内含子,编码244个氨基酸,含有HP1典型的两个保守结构域:CD(Chromo Domain)和CSD(Chrome Shadow Domain);Bcdim-5基因开放阅读框1752bp,含有4个外显子,3个内含子,编码357个氨基酸,含有Pre-SET、SET和Post-SET三个保守结构域。2.Real-time PCR结果表明这三个基因在灰葡萄孢的营养生长、菌核形成和致病阶段均有表达,并且Bcdim-2基因在致病阶段表达下调,Bchp1基因在菌核形成和致病阶段表达下调,Bcdim-5基因在三个阶段的表达水平并无显著差异。3.根据同源重组的原理,分别对这三个基因进行敲除,获得了基因的敲除转化子。深入研究发现,敲除Bcdim-2和Bchp1基因不会影响灰葡萄孢的菌丝生长速度、尖端形态、菌核产生、分生孢子形成及其致病力,但Bcdim-5基因敲除转化子的生长速率减缓25%左右,菌丝尖端形态不变;菌落表面出现白色菌丝纠集,菌核变小变圆,每皿菌核干重下降;分生孢子产生时间推迟,分生孢子量变少;在番茄、拟南芥、大豆上的致病力均有所降低。对Bcdim-5基因进行互补可恢复敲除转化子的菌丝生长速度、分生孢子和菌核形成能力,但其致病力不能完全恢复。4.选取灰葡萄孢中的致病相关基因,检测其在Bcdim-5基因缺失突变体和B05.10菌株中的表达量变化,结果发现在突变体中大部分致病相关基因表达下调,推测Bcdim-5基因敲除菌株致病力的下降与致病相关基因的下调表达有关。本研究初步证实Bcdim-5基因与灰葡萄孢的生长、产孢、菌核形成和致病过程相关,Bcdim-5基因敲除后影响致病相关基因的表达,而Bcdim-2和Bchp1基因缺失后不会影响菌株的正常生长发育,进而推测H3K9的甲基化对灰葡萄孢的生长、产孢、菌核形成和致病均有重要作用,而DNA的甲基化对这些生物学过程调控作用不明显。
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