中央经济工作会议提出我国2016年经济发展的五项任务,其中结构性改革作为主线引领经济发展方向,然而没有创新力量作支撑的结构性改革,只能是空喊口号。当今世界各国的竞争已经演变为创新能力与自主知识产权的竞争,合理引导金融资本与科技资源相互流动配置是当下政府工作的重要举措,科技创新作为推动经济发展的力量,只有与金融资本有机结合才能有效提升我国自主创新能力。目前,我国已经成立科技金融理论研究平台,这不仅在理论层面丰富了我国科技金融的发展,对于区域间科技金融深度结合也有重大意义。高新技术企业作为科技创新的先锋,带动着所有科技创新主体共同建设我国的创新型发展之路。然而,我国东中西部地区高新技术企业发展差距较大,科技金融作为推进创新的力量,在不同区域呈现出不同影响。东部地区作为技术创新领军高地,无论是高新技术企业还是科技金融支持发展都较为完善,而中西部地区由于经济起步晚、产业结构不合理等原因造成了科技金融与科技创新水平的落后现状。2014年我国高新技术企业总产值13250267亿元,其中东部地区9678328亿元,中部地区2255628亿元,西部地区1316311亿元,其差距之大可见一斑。本文基于科技金融相关理论,从我国目前发展现状出发,分析科技金融对我国不同区域高新技术企业创新影响差异。论文共分为五部分,第一部分是从国内外两方面对科技金融的相关理论进行总结分析;第二部分是研究科技金融对区域高新技术企业的创新支持理论;第三部分是通过数据图表对我国不同区域高新技术企业创新现状与科技金融支持现状进行对比,并就其产生差异的原因进行分析;第四部分是通过现状分析构建我国科技金融、高新技术企业创新的指标体系,并进行区域间面板模型分析,以发现各地区科技金融支持高新技术企业创新的问题;第五部分是根据实证检验结果对我国科技金融更好的支持高新技术企业创新提出政策建议。本文通过对科技金融支持区域高新技术企业创新的研究,弥补了区域科技金融相关理论的不足,对我国“供给侧改革”的实施有一定的实践意义。