随着我国机构改革的全面深化,国税地税征管体制也进行了重大调整。这一重大调整有助于理清理顺统一税制和分级财政之间的关系,推进税收现代化,也更有利于发挥税收的三大作用,即国家财政的基础性、支柱性、保障性作用。随着国地税征管体制的全面完成,新税务系统《税务部门经费保障实施办法》随之推出,经费的保障以及财务管理工作都面临着更大的困难和挑战。在财务管理的各项工作中,预算管理是非常重要的一个组成部分,财务部门对各个部门预算的编制科学与否、精细与否都会直接影响到改革后的税务系统的财务管理工作。党的第十九次代表大会中提出了全面实施绩效管理的要求,绩效管理要求财务部门对部门预算的管理水平要不断提升。然而,随着部门预算改革的不断推进,部门预算管理中的矛盾和薄弱环节日益突显,比如编制方式的科学性有待提高,约束性有待完善,预算的执行力度需要增强,预算和实际支出的差异需要减少,这些都极大的影响着税务部门对资金的管理。本文以内蒙古自治区国家税务总局巴林右旗税务局为例,通过利用文献资料法、案例分析法、定性分析和定量分析相结合等研究方法,对巴林右旗税务局预算编制现状进行了分析,得出了巴林右旗税务局税务系统部门预算编制存在的编制项目不全面、相关部门普遍不够重视、参与程度不高、上级设置的定额标准不完全符合实际情况、预算编制方法不够科学、预决算数据偏差大、绩效管理执行不到位等问题的结论,并剖析了产生这些问题的原因。在借鉴美德两国部门预算编制的经验和做法的基础上,提出了优化税务系统部门预算编制的思路和方法,给出了详细的对策及建议:只有提高财务人员业务素质、建立健全的预算管理机制、实行多种预算编制方法相结合、制定科学合理的定额标准、加强预算执行管理、构建完善的绩效管理体系等,才可能为新的税务系统更好的开展税收工作提供有力保障。