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肠道菌群对人体健康的影响究竟多大是目前科学家与公众关注的焦点。最新研究显示:除基因以外,环境变化是造成肠道微生态发生变化的最主要的因素。其中,饮食方式如何参与引起了广泛关注。各类饮食方式、营养成分的差异都引发肠道菌群结构的改变,有的甚至成为引发肠道类疾病的诱因之一。因此,针对不同蛋白质来源的饮食方式对中国人肠道菌群结构及粪便脂肪酸的影响的比对研究对探究饮食与肠道微生态关系十分必要。本研究在2016年10月至2017年3月从青海省、浙江省、黑龙江省搜集到不同蛋白质来源的饮食方式人群的粪便样品16个。根据饮食方式将粪便样本进行如下分类:以植物蛋白为主的素食饮食（n=6）、以动物蛋白为主的肉食饮食（n=5）、混合蛋白摄入的正常对照饮食（n=5）。每组志愿者保持其对应饮食方式至少10年以上。针对本次研究进行如下两部分试验:首先,通过IIumina HiSeq测序平台对三组样本的粪便微生物群的丰富度及多样性进行比较分析;其次,采用高效液相色谱测定对比三组粪便样品中乳酸及短链脂肪酸（乙酸、丙酸、丁酸和异丁酸）的浓度,最后,结合Spearman相关性分析结果探究粪便脂肪酸与肠道菌群间的关系。研究结果显示:不同蛋白质来源的饮食方式的样本肠道菌群的多样性和丰富度发生改变,素食组与肉食组的ACE指数和Chao1指数显著升高（P<0.05）,素食组的香浓多样性指数显著升高（P<0.05）。肠道菌群结构也因饮食方式不同存在差异:在门水平上,无壁菌门在素食组和肉食组中显著升高（P<0.05）,蓝细菌门在肉食组中显著降低（P<0.05）;在科水平上,LEfSe的检测结果中发现肠杆菌科在素食组中的丰富度显著升高;在属水平上,RuminococcaceaeUCG-014和ChristensenellaceaeR-7group的丰富度在肉食组中显著升高（P<0.05）,毛螺球菌属的丰富度在对照组中显著升高（P<0.05）,RuminococcaceaeNK4A214group（P<0.05）和Prevotella7的丰富度在素食组中显著升高。在Beta多样性分析中,PCA和UPGMA聚类结果中均显示不同饮食方式的样本分别聚类,证明保持相同饮食方式的样本肠道菌群结构趋于一致。在粪便脂肪酸的研究结果中,肉食组粪便中的乙酸浓度（mmol/kg）在三组中显著升高（P<0.05）;素食组中总短链脂肪酸的浓度有升高的趋势,但是差异性不显著（P>0.05）。此外,丙酸、丁酸、异丁酸的浓度在三组中没有明显变化（P>0.05）。Spearman相关性分结果显示:RuminococcaceaeNK4A214group和ChristensenellaceaeR.7group与乙酸的产生呈显著性正相关（P<0.01）,双歧杆菌属和丁酸成显著性负相关（P<0.05）。本研究的结果表明,不同蛋白质来源的饮食方式对于肠道微生态具有影响。具体表现在肠道菌群的丰富度和多样性发生变化且观察到差异性物种,保持相同饮食方式样本的肠道菌群结构趋于一致。此外,与肠道微生物相关的代谢产物的浓度也发生改变。因此,不同蛋白质来源的饮食方式下其肠道微生态的结构不同,这证明饮食方式对于肠道微生物结构及其代谢产物具有影响。