循环microRNAs作为潜在的系统性红斑狼疮生物标志物的初步研究

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目的:通过筛选系统性红斑狼疮(SLE)患者血浆中microRNAs(miRNAs)的差异表达,为寻求一种新的无创性SLE生物标志物奠定基础。方法:首先采用Agilent human miRNA芯片筛选并鉴定SLE患者与类风湿关节炎(RA)患者,健康志愿者血浆中表达丰度有显著变化的miRNAs;然后根据循环miRNAs在芯片中差异表达的倍数和潜在的生物学价值,挑选8个miRNAs(miR-126, miR-21, miR-451,miR-223, miR-16, miR-125a-3p, miR-155和miR-146a)在30例SLE患者,25例RA患者,20例健康志愿者之间进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)以验证芯片的数据。为了进一步阐明差异表达循环miRNAs在SLE发病机制中的作用,通过TargetScan软件得到SLE血浆中差异表达的miRNAs靶基因集合,并对靶基因进行KEGG通路分析,获取靶基因集合显著富集的生物学通路,由此推测SLE患者体内异常的循环的miRNAs正是通过调节这些生物学通路而参与SLE发生发展的。结果:(1)通过表达谱分析发现,与健康志愿者血浆相比,SLE患者血浆中有51个异常表达的miRNAs,其中32个显著下调,19个上调;而在RA患者血浆找到了40个差异表达的miRNAs,其中22个显著下调,18个上调。与健康志愿者相比,在SLE患者和RA患者差异表达的循环miRNAs中有35个是重复的。(2)RT-qPCR结果显示与芯片有较好的一致性,其中DNA甲基化相关miR-126在SLE患者血浆是特异性的显著上调,在RA患者血浆中是低表达的;而其它在SLE患者血浆中上调的miRNAs(miR-21, miR-451,miR-223和miR-16)在RA患者血浆中也处于上调的状态。炎性相关miR-125a-3p, miR-15和miR-146a在SLE和RA患者血浆中都是低表达的。(3)通过生物信息学方法分析发现,信号通路主要参与了信号转导,细胞与细胞的交流,其中MAPK信号通路是这些异常循环miRNAs靶基因最显著富集的生物学过程。结论:SLE患者血浆miRNAs的表达水平与正常人血浆有明显的不同,可作为SLE潜在的生物标志物和新的治疗靶点;且这些异常表达的循环miRNAs可能参与了SLE的发生发展。
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