基于iTRAQ技术对耐盐植物乳杆菌FS5-5的蛋白质组学分析

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:killsmagicer
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大酱是东北地区一种深受大家喜爱的传统发酵食品。盐作为大酱的一种主要调味品,在发酵过程中是必须添加的,发酵过程中存在的耐盐性较好的微生物菌群主要是乳酸菌和酵母菌。植物乳杆菌作为一种公认的益生菌,在大酱样品中经常被分离到,对大酱中耐盐性较好的植物乳杆菌进行蛋白质组学研究可以为植物乳杆菌盐胁迫应激机制的研究提供理论依据。本项研究以筛选自东北传统农家大酱的耐盐性较好的植物乳杆菌FS5-5为研究对象,绘制了其在不同盐浓度下的生长曲线,比较了其在不同盐浓度下的细胞形态,并利用iTRAQ技术研究了其在不同盐浓度下的蛋白质表达情况,最后用实时定量PCR技术对关键蛋白质进行了验证试验。1.通过测定在600nm处的OD值,绘制了植物乳杆菌FS5-5在NaCl浓度分别为0.0%、1.5%、3.0%、4.0%、5.0%、6.0%、7.0%和8.0%(wt/vol)时的生长曲线,由生长曲线可以看出,植物乳杆菌FS5-5在不同盐浓度下到达对数生长期中期的时间点分别为5h、5h、6h、7h、8h、10h、12h和12h。2.将植物乳杆菌FS5-5在NaCl浓度分别为0.0%、1.5%、3.0%、4.0%、5.0%、6.0%、7.0%和8.0%(wt/vol)时生长至对数生长期中期的菌体细胞进行透射电镜试验,由透射电镜图可以看出:植物乳杆菌细胞呈短杆状,以二分裂的方式进行分裂繁殖;随着NaCl浓度的不断提高,菌体细胞内外的渗透压逐渐增大,植物乳杆菌的细胞形态也发生了一定的形变,部分细胞出现了细胞质壁分离的情况,甚至出现了内溶物明显外泄的情况。3.将植物乳杆菌FS5-5在NaCl浓度分别为0.0%、1.5%、3.0%、4.0%、5.0%、6.0%、7.0%和8.0%(wt/vol)时生长至对数生长期中期的菌体细胞进行iTRAQ试验,试验结果表明:在1578_UNI_Lactobac库中鉴定到的全部谱图数为343524个,其中匹配上的谱图数为85516个,鉴定到的肽段种类数为11215个,匹配上的蛋白质总数为2056个以差异倍数在1.2倍以上,且p<0.05为筛选条件对1.5%、3.0%、4.0%、5.0%、6.0%、7.0%和8.0%NaCl浓度下与0.0%NaCl浓度下相比出现的差异蛋白质点进行筛选,共筛选出1944个差异蛋白质。通过GO数据库和KEGG数据库对差异蛋白质点进行功能和代谢通路的注释,在盐胁迫环境下,明显发生变化的蛋白质主要包括应激蛋白质、核糖体蛋白质,基因修复与重组相关蛋白质、以及参加糖代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢、脂肪酸代谢、肽聚糖生物合成、能量代谢的相关蛋白质等等。4.通过qRT-PCR对iTRAQ中的一些关键蛋白质进行基因表达水平的验证试验,试验结果表明,基因表达水平与蛋白质表达水平一致,在mRNA表达水平证明了iTRAQ结果的准确性。
其他文献
1基本情况1999年7月,我市某羊场从外地引进一批种山羊后,陆续发生一种以高热稽留(41~42℃)、咳嗽、流浓涕、羞明流泪,孕母羊流产死胎,传染性极强,并呈不间隙零星死亡为特征的
今天,我国依然在大量使用有梭织机,而且这种状况会在未来很长一段时间内存在。那么,为了提高生产效率和质量,对有梭织机及其附属机构进行改进就很有必要。本文主要研究了一种
黄酒营养丰富,市场发展前景广阔,并享有"国酒"美誉,但因质量评价手段较少,导致诸如虚报酒龄、乱贴知名品牌标签和以次充好冒充地理标志产品等非法行为时常发生,严重侵犯了正
客户分类作为客户关系管理(CRM)的重要管理方法,是企业进行市场营销的重要依据.通过对客户进行分类,有利于对客户价值进行准确评估,方便进行精准营销.本文通过对RFM模型数据集
一、概述石英玻璃已有100多年的发展史。由于它有很多极其特殊的优良性能,所以其发展速度是相当快的。目前,它在电光源、半导体和光学等领域内的应用占有相当重要的地位。石
幼儿教育对孩子的成长发展起着至关重要的作用。为营造幼儿良好的学习和活动环境,必须对幼儿园建筑进行科学设计,以同时满足幼儿园的教学要求及孩子的成长需求。由于幼儿年龄
染料/聚合物复合微球因比表面积大、着色性能优异,被广泛应用于生物医学、电子显示、新材料等领域中。本文采用无皂乳液聚合法合成了阳离子微球聚(苯乙烯(St)-丙烯酸丁酯(BA)
由于近几年来纺织品及食品行业方面的安全事件发生频繁,纺织品及食品方面的安全方面的问题逐渐受到关注,同时这两方面的安全问题对我国的对外贸易也产生了很大影响。在日本的
自20世纪初,国内外学者对英语教师角色从各个方面展开了研究,但从独立学院教育背景下入手的探究却为数不多。根据概念整合理论,大学英语教师角色需达到更高的要求。教师应充
目的观察高龄老年急性冠脉综合征(ACS)患者介入治疗的安全性和有效性。方法在我院心内科及老干部科住院期间接受冠状动脉造影检查及介入治疗的100例ACS患者,根据年龄将病例分为