长非编码RNA FAM83H-AS1促进肺腺癌恶性进展的机制研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:liuleizishen
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【背景】长非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是既往研究中常被忽视的一类基因,如今大量的研究结果已表明lnc RNA广泛参与了各种生理及病理过程,并在肿瘤的发生、进展、转移以及耐药等多个过程中发挥了关键作用。本研究旨在探究肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LUAD)中的lnc RNA,筛选出驱动LUAD恶性进展的lnc RNA,并对其作用机制进行深入研究。【方法】本研究通过深入挖掘癌症基因图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肺腺癌数据集中的基因组拷贝数变异(Copy number variations,CNV)数据及转录组表达谱数据建立驱动基因筛选模型,筛选潜在的肺腺癌相关非编码驱动基因。并对筛选出的lnc RNA进行加权基因共表达网络分析(Weighted gene coexpression network analysis,WGCNA),筛选出一条潜在的非编码驱动基因:FAM83H antisense 1(FAM83H-AS1)。体内及体外功能实验验证了该lnc RNA的生物学功能。RNA蛋白结合实验(RNA pull-down assay)、RNA免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)及核质分离实验用于研究FAM83H-AS1下游机制,原位杂交(In situ hybridization,ISH)用于临床样本验证。【结果】首先基于TCGA-LUAD数据集拷贝数变异及表达谱数据驱动基因筛选模型,筛选出一条潜在的非编码驱动基因FAM83H-AS1。随后使用WGCNA分析流程对TCGA-LUAD表达谱数据进行了检验,发现FAM83H-AS1处于T分期相关的基因模块中,提示该基因具有很高的研究价值。体外细胞功能实验表明,FAM83H-AS1可促进LUAD细胞的增殖、迁移、侵袭并显著抑制凋亡,裸鼠皮下荷瘤模型表明,敲减FAM83H-AS1可抑制LUAD细胞的成瘤能力。通过敲降FAM83H-AS1后,对LUAD细胞系进行转录组和蛋白组的高通量检测,并结合RNA Pull-down、RIP以及核质分离实验,发现该lnc RNA通过绑定hn RNPK蛋白出核促进癌基因RAB8B与RAB14的翻译,发挥促进肺腺癌恶性表型的分子机制。在课题组40对LUAD癌和癌旁RNA样本,87对NSCLC癌和癌旁组织芯片样本中验证了FAM83H-AS1高表达于肺腺癌,与T分期相关并显著影响预后。【结论】本研究通过建立驱动基因筛选模型与WGCNA筛选出肺腺癌非编码驱动基因FAM83H-AS1。通过体内外功能实验与分子机制实验阐明了该基因的生物学功能与分子作用机制。本研究从lnc RNA角度揭示了LUAD恶性进展的分子机制,为NSCLC诊断、治疗及预后评估提供了新的理论依据和靶标。
其他文献
张爱玲,这位被称为“洋场社会的仕女画家”的四十年代中国著名女性作家,她作为中国现代女性文学发展的奠定者和推进者之一,以其独特的文字笔触和艺术手法,形成了独树一帜的写
师生关系是教育过程中最重要、最基本的人际关系。这种关系的性质和水平对教育教学活动的效果具有重要作用,对教师和学生的身心发展都会产生深刻的影响。从一定意义上说:教育
随着风电技术的日益成熟,风力发电已成为全球电力系统重要的主流发电技术。无论国内还是国外,都在对风电接入电力系统进行探索和研究,并取得了一定的研究成果。但仍存在一些
田中逸平(1882-1934)于1924年在中国山东省济南市皈依伊斯兰教,为日本伊斯兰教开创者之一、也是日本第二位哈只。尽管如此,他皈依伊斯兰教之后仍没放弃对日本神道与儒教的信
川芎为古今有名的川产道地药材。其性味性温,味辛,是常用中药,主治风冷头痛,旋晕,胁痛腹疼,寒痹筋挛,经闭,难产,产后瘀阻块痛,痈疽疮疡,因此大量出口。但由于我国药典里对川
随着国家"一带一路"倡议的提出,国产影视剧在海外受关注度显著提升。影视翻译在国产影视作品海外推广的过程中发挥了重要作用,同时也出现了一些问题和困难。本文选择生态译学
本文以马克思主义合作制与股份制思想为理论基础,对我国建国以来的农村股份合作制进行了全方位、多角度的研究,论证了我国现阶段的农村股份合作制产生和发展的合理性与必然性。
土地是人类社会赖以生存和发展的物质基础,是农业基本生产资料。随着人口数量的日益增加,人类面临着土地产出不能满足需求增长的威胁。因此正确评价土地资源,特别是农用地资源是
图像配准是图像融合、图像分析、目标变化检测与识别等问题中的重要步骤,其应用遍及军事、遥感、医学、计算机视觉等多个领域。互信息(Mutual Information)来自于信息论,是两
Hall很早就指出:职业生涯是个体在其一生中进入、承担、离开许多工作相关的角色的过程中,一个长期的社会化经历的集合。职业生涯是一个比社会化更宽泛的概念,职业生涯包含了