本文在自然地理学研究内容朝向文化自然地理学转型、地理学应该研究自然过程和人文过程耦合的复合地理过程及区划内容转向功能区划的背景下，借鉴地理学重要思想范式——人地关系地域系统作为指导思想，从要素结构和地理综合体结构两方面采用加权求和方法计算云南省129个县区的功能指数。采用空间插值研究方法来研究云南省可持续发展功能要素结构和地理综合体结构的空间分异现状。在结合各指数的分异格局的基础上，运用系统聚类法研究云南省可持续发展功能区划。云南省可持续发展功能区划研究是丰富和完善地理学理论基础；揭示云南省可持续发展空间现状，为云南省未来的区域规划和产业布局提供理论基础和实践指导。通过以2010为时间尺度对云南省129个县区可持续发展居住容载功能指数、就业保障功能指数、经济发展功能指数、资源保障功能指数、生态维持功能指数及综合功能指数的区划研究、空间分异格局研究得出：云南省综合功能指数空间差异较大，将云南划分为5个区，18个亚区、27个小区；云南省综合功能指数与就业保障功能指数和经济发展功能指数相关性较高；云南省已经形成相对完整、水平较低且空间差异较大的综合功能中心，这些功能中心是未来云南省区域可持续发展规划的重点地区；同时，还结合分析结果进行潜在经济增长极（未来增长极）、现有经济增长极、民族文化中心区、综合经济区、水资源保护区、生物多样性保护区、人类发展聚集区的空间规划初探。